主管反间谍工作的机关是国家安全部。国家安全部是中国政府的情报机构，主要负责处理和打击国内外的所有安全威胁、情报、反间谍活动。

在当前国际局势的复杂性和全球化程度的加深下，国家安全部在维护国家安全和稳定领域中扮演着非常重要的角色，并且随着社会环境、技术发展以及安全威胁的变化，其在反间谍工作方面亦发挥着极为重要的作用。

反间谍工作是国家安全部最为重要的内容之一，它包括情报评估、网络安全、反间谍侦查和情报处置等多个方面。

反间谍工作的目标主要是预防和打击间谍、特务等敌对势力，在敌对势力策划、实施、执行等过程中收集信息或利用情报网络梳理我国的国防、军事、经济、文化等各个领域的情报信息。

在反间谍工作中，国家安全部将重点放在深挖制造、培植、运营、利用、渗透的间谍特务及其组织，特别是打击那些在境内外策划和参与重要领域的间谍活动、危机事件和网络攻击。

同时，节点性及关键领域的防护工作也十分重要，这要求国家安全部与各个行业和领域的主管部门合作，共同推进反间谍工作。

在反间谍工作方面，国家安全部的工作方法更加科学合理，并已经引入了先进技术手段，如大数据分析、网络安全检测和数据挖掘等技术，使反间谍工作的质量和效果得到了提升。

同时，国家安全部还注重加强外交合作，积极与国际反恐和反间谍机构开展合作，共享情报信息，对于解决全球性的安全问题具有重要作用。

总之，国家安全部是中国政府保卫国家安全、维护国家安定、防范反间谍活动最重要和最专业的机构之一。它通过从预防、发现、查处各个环节入手，不断提高反间谍工作水平，保障国家和人民的安全和利益。