The essay that he wrote was excellent .这个句子的深层结构是

主语 the essay
was excellent 系表结构
that he wrote为定语从句，修饰主语

就是个简单的定语从句啊。that he wrote就是定语从句。

essay名词 n.[C]
论说文;散文,随笔,小品文[(+on/about)]
excellent
形容词 a.
出色的;杰出的;优等的[Z]
翻译：他写的那篇散文很棒。
可以分为 ：the essay（主语） / that（引导essay的定语从句作说明，修饰） he wrote（从句的主语和谓语） / was（主句的谓语） excellent（主句的表语） 。可以先提出主句理解，即为 the essay was excellent “那篇散文/论文很棒”；that he wrote 为定语从句，修饰主句的主语“他写的散文/论文”。

这是一个定语从句，主语是the eassay ,was 为系动词，excellent 为表语 。主干结构为 the essay was excellent .即系表结构
that 引导的是一个定语从句，修饰essay